男科排名靠前的医院有中国人民解放军总医院、北京大学第一医院、上海交通大学医学院附属仁济医院等。这三家医院男科分别位居复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》第1名、第2名和第7名。 中国人民解放军总医院在国内首先采用小剂量雄激素治疗男性不育的少弱精症，取得良好的治疗效果，在药物治疗男性勃起功能障碍及早泄等方面处于国内领先水平，在男性勃起功能障碍和不育方面已开展了男性勃起功能障碍的阴茎三件套假体植入术、显微外科输精管吻合术、尿失禁的人工括约肌植入术、腹腔镜及显微外科精索静脉高位结扎术、腹腔镜精囊囊肿去顶减压术、腹腔镜隐睾探查固定术等。 北京大学第一医院2005年成立男科，为国内公立医院中规模最大、诊疗体系最全面的单位，是男科学科的“排头兵”，在国内率先开展阴茎海绵体假体植入手术，以及男科显微手术，成功解决了以往一些治疗棘手的男性少弱精子症、无精症。 上海交通大学医学院附属仁济医院男科始终处于上海市乃至国内男科领域的领导地位。男科疾病临床诊疗规范化程度位居国内领先水平，2012年负责编写《中华医学会男性不育诊疗指南（2013版）》，尤其是无精子症规范化诊疗流程，受到国际同行的关注。其他诊疗特色包括男性勃起功能障碍的早期诊治、早泄的规范化诊疗、不射精症的特色治疗、阴茎发育异常等。