上海比较好的肺科医院排名靠前的是上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院等。其中上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院在复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》中排名第5、第6。 上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸内科为国家临床重点专科，科室拥有独立的门急诊，疑难危重疾病的收治率达40%左右，拥有上海交通大学医学院慢性气道疾病诊治中心、睡眠监测等5个诊疗中心及7个专病门诊。 复旦大学附属中山医院是国内最早建立的肺病学研究室，目前学科形成了呼吸危重症、慢性气道疾病、肺部肿瘤和介入、肺部感染、间质性肺病五大亚专科，同时拥有睡眠室，支气管镜室，肺功能室。其中支气管镜室是国家卫生健康委基于电磁导航系统的早期肺癌精准诊疗试点单位。 复旦大学附属华山医院呼吸科最初以内科呼吸组创建于1956年，成立了中国肺癌联盟肺部小结节早期诊断分中心、肺血管病诊疗中心、慢性气道疾病防治中心、肺部疾病介入诊疗中心等。