上海医院普外科排名靠前的有复旦大学附属中山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属华山医院等。其中，前两家医院的普外科分别位居复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》第2、5名。 复旦大学附属中山医院普外科总体医疗、教学和科研水平一直居于国内领先地位，1997年被列为“211工程”发展规划重点学科，2001年被确定为国家教委重点学科，2002年被列为“211工程”第二期重点建设学科。 上海交通大学医学院附属瑞金医院普外科是上海市重点学科、上海市教委第二期重点建设学科、上海市医学重点学科，形成了以胃肠道癌肿、重症胰腺炎、器官移植、微创外科为特色的，在各个方面具有综合优势的重点学科。 复旦大学附属华山医院普外科为国家级重点建设学科（外科学）、国务院首批博士生培养点、211工程与985重点建设学科（外科学）和卫生部临床重点专科（普外）。下设肝胆外科、胃肠外科、甲乳外科、微创代谢疝外科和血管外科等五个专科。