全国医院排名前十名包括北京协和医院、四川大学华西医院、中国人民解放军总医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院等，分别是复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》第一、二、三、四名。 北京协和医院是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，在复旦大学医院管理研究所公布的《中国医院排行榜》中连续十二年名列榜首。 四川大学华西医院（简称华西医院）也是中国一流的医学科学研究和技术创新的国家级基地，综合实力处于国内一流、国际先进行列。在复旦大学中国最佳专科声誉和最佳医院排行榜上，连续12年名列全国第二，其中12个专科前三、20个前五、30个前十。 中国人民解放军总医院是集医、教、研、防、保健、康复、核生化防护、医学救援于一体，向建设世界一流军队医院迈进的大型现代化综合医院，是全国百姓放心示范医院、全军为部队服务先进医院，一些诊断治疗技术达到国际先进水平。 上海交通大学医学院附属瑞金医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，有着百年的深厚底蕴。医院学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出，尤其在血液内科、心血管内科、肾脏内科等学科方面颇具特色。 其次，还有复旦大学附属中山医院、华中科技大学同济医学院附属同济医院、华中科技大学同济医学院附属协和医院、复旦大学附属华山医院、中山大学附属第一医院。