上海市男科学研究所的工作始于20世纪60年代，经过江鱼教授、王益鑫教授等几代人的共同努力，于2001年12月由上海市卫生局正式批准成立上海市男科学研究所。2007年成为仁济医院第三期特色学科（专业）。目前，本研究所已发展成为集男性疾病临床与科研于一体的临床型研究所，主要方向和任务是研究男性不育、辅助生殖技术、男性性功能障碍、前列腺疾病等疾病的发病机制、早期诊断和治疗方法以及青少年生殖健康服务等。现拥有一本国家级生物医学类专业核心期刊《中国男科学杂志》、上海市唯一的人类精子库、两个男科中心（前列腺疾病研究信息交流中心和仁济-杨森男科研究培训中心）、一个医师协会授权的男科专业医师培训基地，结合医院现有的一个卫生部批准的生殖医学科，为本研究所的工作奠定了良好的基础。经过两次改建，已建立国内外一流的硬件设备，包括：男科常规检测实验室、精子发育与遗传实验室、生殖医学实验室、细胞培养室、分子生物学实验室、VIP诊疗室、性功能检测室、、显微外科培训实验室、病例数据库系统、网络/视频控制室以及建立具有视频播放功能的取精室等。

男性不育症：据估计，每5对夫妇中就有1对不能生育孩子。对于一些夫妇而言，不育成为挫折和苦恼的最常见根源，严重影响生活质量。不育的原因，要么是男方的因素，要么是女方的因素，或者双方的原因。这些原因从单纯的缺乏性行为经验到营养不良、心理障碍以及男方或女方的生殖系统的症状，不胜枚举。所以，外观上显然健康的年轻夫妇，已经有了1年以上没有避孕的性生活，而还没有成功地怀上孩子，要去看医生，寻求专业帮助。男女双方在专业医生细致的医学检查下通常能够找到怀孕失败的原因。根据临床实际，可分为绝对不育和相对不育两种。前者指完全没有生育能力，如无精子症等。后者指有一定的生育能力，但生育力低于怀孕所需要的临界值，如少精症患者，精子活力低下症等。严格讲，只要射精，排出的精液含有活动精子，就有生育的可能。根据不育症的发病过程，又可分为原发不育和继发不育，前者指夫妇双方婚后未受孕者，后者是指婚后有过生育史，或女方曾有怀孕和流产史，但以后由于疾病或某种因素干扰了生殖的某环节而出现不育。

性功能障碍：性功能是一个复杂的生理和心理过程，涉及到神经、精神因素，以及内分泌功能和性器官等各个方面。世界卫生组织把性功能障碍定义为：任何一个个体不能以各种方式参加到他或她所希望的性关系中，包括性欲低下、性厌恶、生殖系统反应消失、性高潮障碍、非器质性阴道痉挛、非器质性性交困难等。简而言之就是个体在性活动过程中不能让自己得到满意的愉悦感。狭义的男性性功能障碍在男性主要表现为阴茎勃起困难、早泄、不射精等。性功能障碍一般根据病因可分为器质性和功能性两大类；按性功能障碍发生的时间分类可分为原发性性功能障碍（从首次性接触就开始有性功能障碍）与继发性性功能障碍（既往性功能良好，以后才发生性功能障碍）。另外一种特殊的类型为境遇性性功能障碍，即对某个性伴侣或在某种环境下发生的性功能障碍，而对其他性伴侣或在另外一种环境下，则性功能完全正常。无论是何种性功能的问题，都会影响生活质量，因此建议患者早期就诊。

前列腺炎是成年男性的常见病之一，当前研究已认为其并非单一疾病而是一组疾病。其中急性前列腺炎是一种定位于前列腺的急性感染性疾病，有明显的下尿路感染症状及畏寒、发热和肌痛等全身症状，尿液、前列腺液中白细胞数量升高甚至出现脓细胞。而慢性前列腺炎是指在病原体或（和）某些非感染因素作用下，患者出现以骨盆区域疼痛或不适、排尿异常等症状为特征的一组疾病。虽然慢性前列腺炎的发病机制、病理生理学改变还不十分清楚，但这一问题常常给患者生理和心理造成了很大的影响，甚至有些患者因久治不愈导致精神不集中、影响工作及学习、影响家庭和人际交往。因此，一旦出现尿频、尿不尽、下腹部胀痛不舒服或是射精不适感，就需要去医院进行检查了。