北京呼吸科比较好的医院排名有中日友好医院、北京协和医院、中国人民解放军总医院等，这三家医院分别位居复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》第二名、第四名、第七名。 中日友好医院的呼吸与危重症医学科是国家呼吸医学中心、国家呼吸疾病临床医学研究中心、中国医学科学院呼吸病学研究院、首都医科大学呼吸病学系依托单位，也是国家重点学科(内科学呼吸系病)、国家临床重点专科、PCCM规范化建设示范单位。 北京协和医院呼吸与危重症医学科作为我国最早成立的呼吸科专业科室之一，是我国一流的呼吸科学临床和研究中心及呼吸疑难病诊治中心，拥有众多的我国呼吸专业的老前辈或知名教授。 中国人民解放军总医院呼吸与危重症医学科，是国家重点学科、全军呼吸病研究所、全军和北京市重点实验室、国内首批PCCM专科医师规范化培训示范单位，是国内规模最大、亚专科设置最全、内外介入一体化的胸科医疗单位之一。学部临床资源极为丰富，医疗水平军队领先、国内第一梯队，科研、教学、力量雄厚。