全国胸科医院排名靠前的有上海市肺科医院、上海市胸科医院、四川大学华西医院等，这三家医院的胸外科分别位居复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》第2、3、4名。 上海市肺科医院胸外科是国家临床重点专科，开展以各类肺、气管及支气管、纵隔、膈肌、胸壁、食道疾病等为主的手术。胸腔镜手术量多年来稳居世界第一。其中无论是微创手术量、疑难手术例数、创新手术术式等都位列全国首列。 上海市胸科医院为我国最早建立的集医疗、教学、科研为一体的，以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的三级甲等专科医院，聚焦胸部肿瘤与心血管疾病两大学科群，掌握国内疾病谱最广、门类最全的心胸疾病诊治技术。擅长各类胸部疾病外科治疗以及肺移植手术，微创外科手术技术处于全国先进水平，达芬奇机器人胸部手术量连续多年保持单中心全国第一。 四川大学华西医院胸外科在国内率先开展局部晚期肺癌的外科治疗（上腔静脉置换术、左心房部分切除术、体外循环下肺动脉主干/主动脉部分切除术），居国内领先水平并达到国际先进水平；创立了食管癌的食管分层吻合技术，极大降低了吻合口瘘发生率，达到国际领先水平；胸内食管胃半机械吻合术也具国际先进水平。