碘伏外涂治疗扁平疣，通常并没有太大的效果，所以也不存在几天能好的问题。碘伏是一种很常用的皮肤黏膜表面杀菌消毒剂，主要是其中含有的单质碘具有强氧化性，对于皮肤表面的细菌、病毒、真菌、微生物等，都有较强的杀灭作用。但是缺点就是穿透力较弱，只能杀伤皮肤表面的微生物，对皮肤表皮深层的杀伤力就很差。

扁平疣只是一种人乳头瘤病毒感染所引起的皮肤病毒性疾病，这种病毒感染之后，局部表皮会增厚、增深。所以在扁平疣的表面，有一层较厚的角质层。

作为一种皮肤屏障，可以阻碍碘伏向深层的渗透，碘伏也无法杀灭在表皮生成的人乳头瘤病毒，所以对扁平疣基本无效。
治疗扁平疣主要使用物理疗法，比如激光、二氧化碳激光或者液氮冷冻，将疣体去除。还可以使用针对扁平疣较好的抗病毒药物，比如干扰素、咪喹莫特等，才可能将扁平疣去除。