如果三天只喝水不吃饭，对身体会产生比较大的影响。在三天禁食的过程中能量被大量消耗，身体变得虚弱。当机体内的糖及糖原消耗殆尽时就会开始动员脂肪、蛋白质作为主要供能原料，尤其在禁食24小时以后，大量消耗用以提供生命所必需的能量，包括基础代谢和活动所需要消耗的能量。
同时由于供能物质改变、体内糖原消耗殆尽，身体内产生大量酮体，需要糖作为主要供能的组织也会出现功能下降。其中大脑组织平日只是以葡萄糖进行供能，改为酮体供能后，大脑功能会出现反应速度下降，计算力、记忆力、定向力等脑功能皆出现不同程度的下降。除此之外，长时间禁食可能导致身体免疫力下降，容易生病，尤其是呼吸道感染性疾病和消化系统疾病的发病率会明显升高，其中消化系统容易出现因胃酸过多而无法中和，导致胃炎加重。因此，不建议三天只喝水不吃饭。