北京做肝囊肿手术好的医院有北京协和医院、中国人民解放军总医院院等，这两家医院的外科均荣登复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》，分别位居第一名、第四名。肝囊肿应就诊于肝胆外科。 北京协和医院肝脏外科重视临床及基础科研，科研成果丰富。早在上个世纪的50年代就开展了肝脏手术，是国内开展肝脏切除手术最早的医院之一，之后在北京协和医院基本外科肝脏专业组的基础上发展到肝脏外科中心，一直到目前独立的肝脏外科，经历了半个世纪的成长过程，至今发展壮大。该科室拥有较完善的人才梯队，开展的治疗项目较多，积累了大量的临床经验，拥有较高的诊疗水平。 中国人民解放军总医院肝胆胰外科医学部，是解放军总医院在新的编制体制下，打造的“国内领先、世界一流”的肝胆胰外科专业，是集肝胆胰战创伤救治、疑难危重病诊治、临床科技创新和军地高层次人才培养为一体的享有盛誉的肝胆胰外科中心，在科室相关疾病诊疗方面有较高的水平。