福州市三甲医院名单较多，相对较好的有福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院等。其中，福建医科大学附属第一医院登上了复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》第84名，而福建医科大学附属协和医院为第88名。 福建医科大学附属第一医院作为市级综合性医院龙头单位，充分发挥市级疑难危重症学科优势，拥有福州市颅脑损伤急救中心、福州市脑血管病诊疗中心等4个临床诊疗中心，是12个医疗质控中心的挂靠单位，也是国家级胸痛中心单位。 福建医科大学附属协和医院为八闽现代医学的发祥地，医院综合实力雄厚，拥有国家级、省部级等高层次人才百余名，系国家综合类区域医疗中心、国家心血管病区域医疗中心，救治疑难危重疾病的能力达国内先进水平。 其他比较推荐的三甲医院有福建省立医院、福建省肿瘤医院、福州市第二医院等，这些医院拥有世界先进的设备及医疗、教学和科研平台，临床经验十分丰富，专业技术处于国内领先水平。