在囊肿手术以前，需要通过系列的检查，对患者的全身情况，有细致评估。另外手术前要对患者进行常规的X线、CT或者其它影像学检查；

根据囊肿的相关因素来决定手术切口；

颌骨囊肿的手术，目前一般都是在全麻下进行；

在手术的过程中，第一步是要切开表面的黏膜或者皮肤，来暴露手术的区域。一般根据术前X线上显示的囊肿位置，去除一部分颌骨骨质，就可看到囊壁；

小心地把囊壁完整彻底去除；

如果上颌的囊肿，跟上颌窦的关系很密切，有粘连，一般会把上颌窦的黏膜一起刮除掉。然后对形成的残留囊腔，进行认真冲洗，仔细止血。必要情况下填塞碘仿海绵，保证术后不再出血。

最后一步就是对囊腔的严密缝合。

如果病变累及的范围很大，患者也不希望做一个很大的手术，还有另外一个选择，即开窗引流袋形手术。