1941-1952年仁济儿科作为内科一部分。1952年儿科正式建科。1954年仁济儿科全部迁往广慈医院合并成立上海第二医学院儿科系。1958.4仁济医院重建儿内科，设有门诊及病房，至1990年增至40张床位。1992年仁济医院于浦东塘桥筹建东院，同时于东院开设儿科专家门诊及专科门诊。2012.12应响应上海卫生局“5+3+1”工程，东院儿科关停，于浦东浦江镇开设仁济南院儿科，设有门诊及病房。目前仁济西院儿科床位24张，南院儿科24张。

1941年前仁济儿科作为内科一部分由英籍女医师汤娃司等兼管，1941年后由华人内科医师何致雄兼管。1946年郭迪回国于仁济医院任儿科顾问，并于1952年担任首任儿科科主任。后经黄惟章、许积德、莫宝泰、钱琦、邓碧尔、曹兰芳、卢燕鸣历任科主任及科室成员努力，儿科涉及领域由原先单一的感染性疾病，先后扩展至儿童保健、血液、肾脏、心血管、消化、中西医结合、风湿免疫、变态反应疾病等不同亚专业。目前仁济儿科形成以儿童风湿和过敏为诊疗特色。