一般情况下，导致肾盂输尿管连接处梗阻的原因包括两方面。一方面是先天性的肾盂输尿管交界处狭窄，即先天性发育异常可导致肾盂输尿管交界处的输尿管蠕动能力不佳，进而引发梗阻；另一方面是其他医源性因素或者外来因素，比如手术、外来肿瘤及血管压迫或外伤导致此部位出现梗阻，从而引起肾盂输尿管的尿液聚集，进而产生结石。因此，其治疗需要针对病因进行治疗。如果为先天性肾盂输尿管交界狭窄导致的结石，首先要解除梗阻、狭窄，进而再处理结石。解除梗阻、狭窄的手段较多，目前临床较为常见，且应用较多的为腹腔镜微创手术。该手术可将狭窄段切除，异位血管离断，或者将一些外来压迫解除。目前处理结石的方法较多，临床上以输尿管镜、输尿管软镜，以及经皮肾镜较为常见，即微创处理结石。其中输尿管软镜，目前亦可定义为无创处理结石的方式。

胱氨酸结石属于一种非常特殊的结石，并且为一种遗传性疾病，复发率极高，而且目前没有明确的预防方法。一般情况下，胱氨酸结石容易在儿童时期出现。胱氨酸结石是由于一种染色体的突变，引发胱氨酸分泌过多导致。目前烟台毓璜顶医院的结石标本库，已经记录将近4000例的结石患者中，只有约40例的胱氨酸结石患者。目前临床上只有等待胱氨酸结石出现后再进行处理，因为胱氨酸结石为一类遗传性疾病，目前无其他的预防措施。所以对于胱氨酸结石，大家一定要特别注意，它极容易于早期形成柱型的双肾结石。

肾盂输尿管连接部即肾盂与输尿管连接的位置，此部位为排尿的必经之路，即肾脏通过血液循环形成尿液以后，必须通过肾盂进而通过一种机械的蠕动作用，以及输尿管的排泄作用，将尿液挤到输尿管内部，输尿管再通过蠕动逐步将尿液排入膀胱。当肾盂输尿管(连接部)由于各种原因出现梗阻以后，会产生结石。因为肾盂输尿管连接部有一种先天性疾病，称之为肾盂输尿管先天性狭窄。同时还有部分后天性疾病，比如外来压迫、医源性因素以及外伤可导致狭窄，会导致肾盂积水。所谓的积水实际上为积尿，即尿液位于肾盂中通而不畅，较多尿中的高钙物质或者高草酸物质于肾盂中沉积，从而形成结石。所以肾盂输尿管连接部的结石为临床上比较常见的结石，它的病因应该为肾盂输尿管连接部狭窄所致。