食物吸收的主要部位是小肠，小肠位于腹部，上端起于胃幽门，下端接续盲肠。分为十二指肠、空肠和回肠3部分。

• 十二指肠：介于胃与空肠之间，由于相当于十二个横指并列的长度而得名，全长约25cm。

• 空肠和回肠：空肠常位于左腰区和脐区；回肠多位于脐区、右腹股沟区和盆腔内。

小肠主要有消化食物及吸收营养的功能。食物会先在十二指肠被胆汁及胰液所消化；接着进入空肠，小肠肌肉会自动不断搅拌食物，先由消化酶将食物分解成微粒状；再到回肠里吸收水分，同时吸收钙等矿物质及以维生素B为主的维生素，最后才会由小肠壁来吸收所有消化过后的养分。

食物在消化过程中，可将碳水化合物转变为单糖，将蛋白质转为氨基酸，将脂肪转为脂肪酸和甘油，这些产物就在小肠内被加以吸收。食物通过小肠的所需时间为3-8小时，有92%-97%的食物会被消化吸收，剩下的渣滓就会被送到大肠里去。