卵巢实质分为外周的皮质和中央的髓质，二者分界不明显。皮质较厚，由不同发育阶段的卵泡、黄体及其退化后的残留物，以及富含梭形基质细胞和网状纤维的结缔组织等构成；髓质较薄，为疏松结缔组织，其中无卵泡，但含有较多的弹性纤维、血管、淋巴管和神经。

卵巢组织结构有明显的年龄性变化，主要是皮质中卵泡发育呈周期性改变。从青春期至更年期，卵巢在垂体分泌的促性腺激素影响下，按月经周期呈周期性排卵。每28天有15-20个卵泡生长发育，一般只有1个优势卵泡能发育成熟并排卵。正常女性一生中约排卵400余个，其余大部分卵泡均在发育的不同阶段退化为闭锁卵泡，绝经期后卵巢不再排卵。