航空工业三六三医院胃肠胸外科是中航医疗临床重点培育学科（微创），双院区设有编制床位114张，拥有一支经过专业培训、年轻化、高素质，集临床、教学、科研为一体的充满活力的专科人才队伍。现有医师14名，其中主任医师2名，副主任医师4名，主治医师名5，住院医师3名(硕士研究7名)。护理人员32名，主管护师8名，护师14名。单院区年手均术量1500余例。科室设有普胸专业组、胃肠专业组、甲乳专业组、疝外科及血管外科五个亚专业组。以消化道疾病的外科治疗为主体，常规开展食管癌、贲门癌、胃癌、结肠癌、直肠癌、肛肠疾病等各类消化道疾病的手术治疗，对肺肿瘤、纵膈肿瘤、甲状腺乳腺肿瘤、各类疝实施规范化手术，取得满意效果。科室在四川省内较早开展胸腔镜及腹腔镜技术，适用于绝大部分胸部及腹部疾病的诊断和治疗。手术视野清晰、安全性高。优点：创伤小、痛苦轻、疗效可靠、恢复快、切口美观。目前已开展单孔胸腔镜技术，创伤更小。秉承“病人至上”的核心理念和“全心全意”为病员服务的宗旨，科室全体医护人员致力于为病员提供高质量的医疗服务。科室特色诊疗项目胸腹腔镜联合食管癌手术：食管癌手术采用胸腔镜、腹腔镜联合微创化手术，创伤小、术后并发症少、恢复快。胸腔镜肺结节、肺段切除术：肺磨玻璃结节、早期肺癌、肺段手术，保证手术范围基础上最大限度保留肺组织、肺功能。腹腔镜微创胃、肠癌手术：腹腔镜手术开展近20年，高清3D腔镜手术技术使手术尽可能达到无血化、微创化。乳腺包块微创手术：采用美国巴德公司的EnCor乳腺真空辅助旋切系统在彩超定位监测下行微创手术，可对乳腺0.5-3cm良性肿块切除，早期乳腺癌术前确诊活检。切口小、愈合美观、恢复快。环状痔疮治疗新技术：吻合器痔上黏膜环切术（PPH）及TST手术，有效治疗脱垂痔和直肠黏膜脱垂的全新手术方法，可减轻术后疼痛、减少术后复发、缩短住院时间、加快康复周期、改善生活质量。腹股沟疝腹膜前修补术：全麻腹腔镜TEP手术或者局麻下开放成人腹股沟疝腹膜前修补术，适合不同患者需求，修补牢靠、复发率低、创伤小、恢复快。甲状腺癌术中纳米碳淋巴示踪技术：甲状腺癌术中使用纳米碳进行淋巴示踪，淋巴管及淋巴结显影，有利淋巴结清扫及甲状旁腺保护，提高手术效果及手术安全。