武汉肛肠科比较好的医院有华中科技大学同济医学院附属同济医院、华中科技大学同济医学院附属协和医院、武汉大学人民医院。 华中科技大学同济医学院附属同济医院普通外科不仅是同济医院的重要组成部分，而且在国内乃至国际外科界均享有较高的声誉，是国家教委的全国重点学科。采用电子胃镜、纤维结肠镜等早期诊断胃肠疾病并及时予以手术。各种新术式的应用，如胃大部切除、幽门再造术治胃十二指肠溃疡、胃癌的规范性根治切除术、直肠癌手术及其术后腹腔内局部化疗等，大大提高治疗效果。尤其胃癌病人的长期生存率和生活质量不断提高。 华中科技大学同济医学院附属协和医院胃肠外科是普通外科的重要亚专科，专科下设有胃外科、结直肠外科、肛肠外科、减重代谢外科、疝外科及疑难危重疾病（消化道出血、炎性肠病、肠梗阻、肠瘘）等亚专业组。面向全国及全省推广胃癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤等微创化、规范化、个体化、立体化“四位一体”的多学科综合疗法，并开设了“胃肠道肿瘤多学科联合门诊MDT”、“胃肠道间质瘤专科门诊”等。 武汉大学人民医院普通外科，是由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成。熟悉普通外科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗直肠肿物、直肠癌、胆囊结石、胆总管结石、胆囊癌、肠梗阻、消化道穿孔、混合痔等方面具有显著优势。