福州肺科比较好的医院包括福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院等。肺科一般属于呼吸内科相关科室，其中福建医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科是国家首批PCCM（呼吸与危重症医学科）规范化建设三级医院优秀单位，国家卫计委首批PCCM专科医师规范化培训基地，中国医师协会首批PCCM专科规范化进修基地及睡眠呼吸疾病、肺功能检查单项规范化进修基地，在睡眠呼吸障碍性疾病、肺血管疾病、慢性气道疾病、间质性肺疾病、呼吸危重症等疾病的医疗水平位列省内前茅；福建医科大学附属协和医院呼吸内科对各种呼吸道疾病如慢性阻塞性肺病、肺部结节、肺气肿、肺心病、支气管哮喘、支气管扩张、肺癌、各型胸水、各型肺炎、鼾症（睡眠呼吸暂停综合征）、支气管炎及间质性肺炎、肺动脉高压、肺栓塞等呼吸科的疑难杂症、少见病等都具有极丰富的诊断和治疗经验，深受广大患者的好评。