上海市甲状腺医院没有权威的排名前十名划分，相对较好的医院有上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院等。 上海交通大学医学院附属瑞金医院甲状腺血管外科是国内率先开启疑难甲状腺和甲状旁腺多科整合门诊，在甲状腺微创手术、疑难局晚甲状腺手术、MDT诊治领域和甲状旁腺疾病全国领先，擅长多种模式、个体化的甲状腺微创手术，在机器人甲状腺手术领域全国领先。 复旦大学附属中山医院普外科熟悉甲状腺外科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗甲状腺功能亢进、甲状腺功能减退、甲状腺炎、甲状腺结节、甲状腺囊肿、甲状腺腺瘤、甲状腺肿瘤、结节性甲状腺肿等方面具有显著优势。 复旦大学附属华山医院甲乳外科熟悉甲状腺外科常见病、多发病、疑难病的诊治，在甲状腺肿瘤的早期诊断，合理掌握手术指证，手术的精准，喉返神经监测，淋巴结示踪，甲状旁腺保护等方面积累了丰富经验，并开展腔镜甲状腺乳腺手术。