抽动症治疗比较好的医院是复旦大学附属儿科医院、首都医科大学附属北京儿童医院等。抽动症应就诊于小儿神经内科，这两家医院在复旦版《2021年度中国专科声誉排行榜》小儿神经内科专科分别排名第1和第2。 复旦大学附属儿科医院是当时全国成立最早的儿科神经专业之一，科室组建目前包括神经科病房、神经专科门诊、神经脑电生理监测工作站、神经肌病室。具备与神经专科相配套的神经外科、神经影像、神经病理、神经康复、分子遗传诊断、药学和护理等多个专业领域。技术水平在国内领先，对抽动症有丰富的治疗经验。 首都医科大学附属北京儿童医院神经内科包括两个神经内科病房、神经内科门诊(普通门诊、专病门诊、专家门诊、特级门诊、特需门诊、特需小夜加班门诊)、电生理检查室(脑电图室及肌电图室)、神经肌肉病理会诊。开展了长程视频及24小时脑电图监测、肌电图与诱发电位、智力测查及心理测试、基因检测、代谢筛查、神经肌肉病理等检查。