新疆医科大学第六附属医院擅长心血管内科、骨科、神经内科等。
1、心血管内科
新疆医科大学第六附属医院心血管内科是由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成。熟悉心血管内科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其对冠心病、心力衰竭、冠状动脉粥样硬化性心脏病、高血压、房颤、心绞痛、心肌梗死、心动过、房扑等疾病有显著优势。
2、骨科
新疆医科大学第六附属医院骨科曾为铁道部重点专科，目前是自治区重点专科。是以收治创伤和骨科疾病为主，集医疗、教学和科研于一体的骨科专业科室。擅长诊治骨折、先天结构异常骨折、髋膝关节置换、肩周炎、脊柱炎、腰间盘突出症、坐骨神经痛、旧性骨折畸形愈合、骨不连、复杂关节内骨折、骨盆髋臼、股骨头坏死等疾病。
3、神经内科
新疆医科大学第六附属医院神经内科，2013年经审批为新疆首批神经内科住院医师规范化培训专科基地，自治区神经内科重点专科，国家神经系统疾病临床研究中心首都医科大学附属北京天坛医院神经系统疾病专科联盟成员单位，天坛神经介入联盟成员单位，中国帕金森联盟成员单位。在诊治脑梗塞、脑出血、偏头痛、脑炎、脑膜炎、癫痫、痴呆、三叉神经痛、坐骨神经病等疾病方面有显著优势。
