阜新市三甲医院有阜新市中心医院、阜新矿业集团总医院、阜新市中医医院。阜新市中心医院拥有五个市级重点专科，学术发展达到省内领先水平；阜新矿业集团总医院率先开展了阜新市第一例冠状动脉造影术，填补了市内在心血管诊断领域的空白；阜新市中医医院是全国百强中医医院，拥有国家级重点专科、省级重点专科等。
第一名：阜新市中心医院
阜新市中心医院是一所集医疗、预防、康复、教学为一体的综合型国家三级甲等医院，拥有普通外科、消化内科、血液透析中心、神经外科和食管癌治疗中心等五个市级重点专科，学术发展达到省内领先水平。近年来开展的新技术项目获各级科技进步奖23项，医务人员在各级医学期刊上发表论文及专着260余篇，先进医疗设备也不断完善，大大提升了医院的整体医疗水平。
第二名：阜新矿业集团总医院
阜新矿业集团总医院购入了具有国内领先水平的DR、DSA先进的数字化影像设备，更新了除颤监护仪、血球计数仪，购置了彩超工作站，扩添了血液透析机等。率先开展了阜新市第一例冠状动脉造影术，填补了该市在心血管诊断领域的空白。一年中曾有7项技术获市级科技进步奖，有60余篇论文在国家级杂志上发表，有9项技术申报科研立项。
第三名：阜新市中医医院
阜新市中医医院是一所三级甲等综合性中医医院，全国百强中医医院，荣获多项国家、省、市级荣誉称号。拥有国家级重点专科—中医外科，省级重点专科—骨伤科、脑病科，市级重点建设专科—皮肤科、乳腺科、肺病科、针灸科。设立中国工程院院士、国医大师石学敏“院士专家工作站”，中国中医科学院广安门医院“贺用和教授专家工作站”，安淑平“辽宁省名老中医工作室”及“全国针灸临床研究中心阜新分中心”等。
第四名：阜新市第二人民医院
阜新市第二人民医院现有神经内科、妇科、产科三个市级重点专科；拥有阜新市产前诊断中心、阜新市危重孕产妇抢救中心、阜新市危重新生儿抢救中心三个市级专业中心；十一个市级质控中心、三个国家级住培基地、两个市级疾病防治办。现已成为阜新地区微创技术发展的领军力量。医院PCR实验室开展的DNA检测技术填补阜新地区空白。2020年医院跻身全国地市级医院500强行列，在阜新市卫生系统绩效考核中连续多年名列第一。
第五名：阜新蒙古族自治县人民医院
阜新蒙古族自治县人民医院是一所集医疗、科研、教学、预防为一体的县级综合性医院，也是本省第一家被国家评审通过的二级甲等医院，为自治县乃至周边地区的人民群众提供了先进、科学、现代化的医疗服务场所，为自治县的经济发展和社会稳定做出了重大贡献，受到了社会各界的广泛赞誉。