儿童眼科医院排名第一的医院是中山大学中山眼科中心，该院的小儿与遗传眼病专科可为0-14岁的儿童提供专业的眼病诊断和治疗，开展了华南地区乃至中国的的儿童眼病诊疗工作。此外，儿童眼科医院排名比较好的还有首都医科大学附属北京同仁医院、复旦大学附属眼耳鼻喉科医院等，首都医科大学附属北京同仁医院的斜视与小儿眼科在国内斜弱视专业居于前列；复旦大学附属眼耳鼻喉科医院的小儿眼科与斜弱视学科对斜视、复视、眼性斜颈、眼球震颤的诊治均处国内领先或国际水准。
第一名：中山大学中山眼科中心
中山大学中山眼科中心小儿与遗传眼病专科，是提供专业诊疗指导和辅助检查的综合性服务平台，致力为0-14岁的儿童提供专业的眼病诊断和治疗。该科室以“一站式服务”为模式，为各亚专科儿童眼病诊断、治疗、预防等在一次镇静中完成所有所需的辅助检查并给予专业指导，旨在更好地服务于华南地区乃至中国的的儿童眼病诊疗工作。
第二名：首都医科大学附属北京同仁医院-斜视与小儿眼科
首都医科大学附属北京同仁医院斜视与小儿眼科，在国内斜弱视专业居于前列，对于特殊性斜视、难治性弱视等疑难复杂专科疾病有丰富的诊疗经验。临床医学上具有强大的专科优势，医疗水平国内领先，与国际接轨。发表的相关论著获国家科技进步2等奖1项，获北京市科技进步三等奖2项，北京市卫生局科技成果二等奖1项。
第三名：复旦大学附属眼耳鼻喉科医院-小儿眼科与斜弱视学科
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院小儿眼科与斜弱视学科，对各种斜视、弱视及儿童屈光不正的诊治具有丰富经验，对斜视、复视、眼性斜颈、眼球震颤的诊治均处国内领先或国际水准，对儿童眼病、先天性白内障等建立起了一套完善的筛查和诊治体系，并开展各种遗传性眼病的临床和基因诊断及咨询。
第四名：天津市眼科医院
天津市眼科医院斜视弱视与小儿眼科，是由医院已故眼科专家赫雨时教授在国内最早创建，开展了一系列临床研究，治愈了大量疑难、复杂甚至多次手术效果不佳的斜视患者。多年来，在斜视弱视临床方面，特别是在难治性复杂性斜视，如垂直旋转斜视的诊断和外科治疗方面形成明显的优势和特色，在国内居领先地位，具有权威性影响。
第五名：浙江大学医学院附属第二医院-眼科
浙江大学医学院附属第二医院眼科是国家临床重点专科、国家重点（培育）学科、浙江省和浙江大学重点学科，浙江医学支撑学科。学科设有白内障、玻璃体视网膜病、青光眼、屈光手术、小儿与斜视弱视、眼整形及眼肿瘤、眼表及角膜病、眼视光、神经眼科、葡萄膜等10大专业学组，开展全方位的眼科诊疗和手术，眼科诊疗和手术水平始终处于国内领先，国际先进水平。
第六名：温州医科大学附属眼视光医院
温州医科大学附属眼视光医院是目前浙江省唯一一家省属公立三级甲等眼科专科医院。医院承担临床医疗、医学教育、医学科研、预防保健等任务，是国家临床医学研究中心（眼耳鼻喉疾病）、眼视光学和视觉科学国家重点实验室、国家眼科学临床重点专科。 医院专科齐全，目前共设24个临床亚专科，其中视光学专科、眼鼻相关专科、屈光手术专科、角膜病专科等在国内乃至国际都有着较大的影响力。
第七名：北京协和医院-眼科
北京协和医院眼科是我国最早成立的眼科，成立后许多国际一流的眼科学家曾在这里主持工作，被誉为“东方的维也纳眼科中心”。现在的协和眼科已成为专业齐全，融医、教、研为一体的眼科基地，整体水平在国内处于领先地位，一些项目达国际先进水平。是国内首批硕士、博士学位培养点和博士后流动站，首批住院医师规范化培训基地。
第八名：上海交通大学医学院附属第九人民医院-眼科
上海交通大学医学院附属第九人民医院眼科是以眼整形眼眶病为特色、玻璃体视网膜病、白内障、青光眼、眼表角膜病、眼视光和斜弱视等专业全面发展的学科。连续四年荣获中国医院最佳专科声誉排行提名，2016年获中国医院科技影响力排行第七名。该科室拥有先进的医疗设备，率先将内镜导航手术系统应用于眼眶骨折修复，眼眶深部肿瘤摘除，眼眶减压手术，达到国际先进水平。
第九名：上海市第一人民医院-眼科
上海第一人民医院眼科是国家临床重点专科、上海市重中之重临床医学中心、上海市眼科研究所、上海市眼底病重点实验室、上海交通大学眼科研究所、上海市眼科住院及专科医师培训基地、上海交通大学眼科学博士点、博士后流动站、南京医科大学眼科学博士点、博士后流动站，上海交通大学医学院眼科及视觉科学系所在地。在2018年度中国医院专科声誉排行榜，中心位列全国第九，综合性医院眼科第四，进入全国眼科第一方阵，七年内排名上升两位。
第十名：北京大学人民医院-眼科
北京大学人民医院眼科是一所集医疗、教学、科研为一体的现代化眼科临床与研究基地，是国家重点学科、国家重点专科、国家药品监督管理局眼科药物研究基地，是全国首批获得医学技术眼视光学一级学科博士学位授权点的5所高校之一，多年来在全国眼科机构排名复旦排行榜中稳居全国前十。