传统肛瘘手术是把肛瘘切开以后不缝合，创面开放，开放的创面会有少量渗血，所以手术做完了包扎时要填塞敷料和纱布到创面压迫止血。肛门平常是空置状态，有粪便到直肠下端到肛管就会有明显便意。术后塞纱布，即使没有粪便麻醉，药效过以后也会感觉到明显便意感，所以比较难受。病人一般都着急拔出，但是过早拔出来会引起出血。 所以一般情况术后第二天换药时把纱布取出来，这时候要观察创面。如果还有明显出血还需要再填塞纱布；如果没有明显的出血，就可塞入一根很小的引流条，上面带着药，还要塞到创腔里。引流条在每天换药时都要更换，一般住院一周，出院以后创面里面如果没有明显坏死组织，病人回家以后就不需要再填塞纱布。

肛周脓肿目前有完全切开术或者切开引流加挂线等根治手术。尚无微创的根治手术，肛周脓肿切开引流、细针穿刺抽脓或者B超引导下穿刺引流，都属于创伤比较小、缓解症状的手术方法，但不能彻底根治。 通过上述引流方法处理后往往会形成肛瘘，在Ⅱ期肛瘘手术时可以采取微创的方法治疗，比如肛瘘挂线术、瘘管清创加纤维蛋白胶注射、肛瘘栓填塞术、括约肌间瘘管结扎术、括约肌间瘘管结扎加肛瘘栓填塞术，以及视频辅助下肛瘘治疗术等。 视频辅助治疗肛瘘这种方法是近几年才兴起的一种新的微创治疗办法，是通过瘘管镜插入到瘘管腔内，然后搔刮瘘管内的坏死组织，术后加用蛋白胶封堵瘘管腔，然后再缝合瘘管内口。

肛瘘手术后流脓肯定不正常，但患者有时很难区分这脓是真脓，还是假脓，因手术创面开放会有些渗出，会有分泌物甚至肠液溢出，很多患者会把这些分泌物、溢出液、肠液当成脓。 实际上这不是脓，是正常液体、分泌物、肠液。如是脓液，肯定不正常，如有脓液说明有脓腔未处理。如确实有脓液，需手术医生再次探查有无遗漏脓腔。实际上大多数患者刚做完手术后还流脓，这脓实际上是常见分泌物和肠液。 有的患者会问，此分泌物何时会少或无，需根据手术切口大小决定，一般手术切口完全愈合后，分泌物会彻底消失。如患者分不清楚是脓液还是正常分泌物，换药时可与手术大夫咨询，一般医生会仔细解释、仔细检查。