曲阜市中医院眼科为鲁西南眼科联盟成员单位、北京眼科专家常驻单位、中华医学会眼科济宁分会委员单位，科室配备免散瞳眼底照相造影仪、多波长眼底激光治疗仪、裂隙灯显微镜、全自动非接触式压计、自动屈光曲率仪、综合验光仪、超声乳化仪等先进医疗设备，对眼科常见疾病如白内障、青光眼、眼眶病、眼表疾病、翼状胬肉、泪囊炎提供相关手术治疗及中医中药康复治疗；开设了小儿斜弱视、屈光不正（近视、远视、散光）矫正、治疗及验光配镜，擅长对各类视网膜病变及眼底出血性疾病诊断及治疗。