如东县中医院肛肠科建科于1981年，现为南通市中医重点专科、江苏省中医重点专科，南通市结直肠肿瘤筛查基地。现有床位50张，医护人员23名，年门诊量约14000人次，年收治病人1500人次。其中主任中医师2名，副主任中医师2名、主治医师2名、硕士研究生3名，住院医师5名，南通市名中医1名。为南通地区规模最大、技术力量最强、业务量最大，具有广泛影响的、唯一的省级肛肠病中医重点专科。近年来，肛肠科在科主任顾建华主任中医师，南通市名中医的带领及科室全体同仁共同努力下，通过进四十余年的发展，在治疗上针对肛肠科常见病、及急危重疑症，总结出了一套行之有效的中医、中西医结合治疗方案，特别是对各种复杂性肛瘘、高位肛周脓肿、环状混合痔等治疗方法独特。在手术方法上采用传统手术与微创手术相结合，体现了中医个体化治疗的特色和境界。在总结祖国医学治疗经验的基础上，研制了瘘痔消洗剂、痔得宁栓等中药制剂，研制了炎宁灌肠液、仙桔汤等具有明显疗效协定处方，经过多年临床验证，在治疗肛门直肠疾病方面具有可靠的临床疗效，深受广大患者赞誉。科室形成了具有专科特色的、行之有效的、独特的疗法：其中肛裂切开松解术、肛周脓肿一次性切开引流挂线术，术后肛门功能完好，受到了广大患者的好评及国内肛肠专家的充分肯定。分段切开对口引流挂线术治疗高位复杂性肛瘘，降低了复发率，缩短了治疗时间。在痔病的微创治疗方面，肛肠科近些年通过不断创新及引进。目前已广泛开展了环形痔吻合器手术（PPH术）、选择性痔上粘膜切除术（TST）、超声多普勒引导下痔动脉结扎术（DG-HAL）、痔上粘膜套扎悬吊术（RPH）、STARR技术，痔核本体套扎术、泡沫硬化剂注射术等手术，显著地减轻了术后疼痛，缩短了住院时间，尤其适用于高龄及不能耐受常规手术的患者。在麻醉科的配合下，采用腰俞麻醉结合病人平衡镇痛技术，有效地减轻了患者围手术期内的疼痛，获得了患者的一致好评。中药熏洗治疗肿痛型外痔，经过临床验证有效率达90％以上。改良PPH手术治疗因直肠粘膜脱垂而引起的便秘，收到显著效果，为治疗便秘开辟了一条新途径。科室共承江苏省中管局、南通市科技局课题五项，先后获得南通市科技进步奖四项；南通市医疗新技术引进奖二项；优秀中医药项目奖二项；授权国家发明专利二项，撰写《中国肛肠病学》《中医临床诊断与治疗技术》《肛门病保健》专著三篇。