新疆医科大学第四附属医院(新疆维吾尔自治区中医医院)成立于1959年7月1日。1986年4月，医院成为新疆中医学院附属医院；1998年9月，医院成为新疆医科大学附属中医医院。2001年11月，医院与新疆维吾尔自治区中医研究所合并，同时挂新疆维吾尔自治区中医药研究院、新疆医科大学第四临床医学院和新疆中医名医名方研究开发中心的牌子。六十余年的积淀，尤其是近二十年来的快速发展，医院已成为全国规模较大、中西医人才汇聚、学科设置齐全、技术力量雄厚、中医特色突出、设备配套先进，集医疗、教学、科研、预防保健和康复于一体的三级甲等中医医院。医院同时是国家中医临床研究基地、国家中医药传承创新工程重点中医医院项目建设单位、国家中医药优势特色教育培训基地、国家中药炮制传承基地、国家“中医药国际合作基地”、国家药物临床试验机构、并设有国家级博士后科研工作站。医院中药炮制研究实验室及呼吸病研究实验室是自治区重点实验室。
医院设有102临床医技科室，27个行政后勤科室，3个门诊部，1个分院，1个分部。医院现有职工三千余人。医院有国医大师1人，全国名中医3人，全国中医药高等学校教学名师1人，国务院政府特殊津贴专家9人，国家岐黄学者1人，国家青年岐黄学者1人，自治区中医民族医名医4人，全国老中医药专家学术经验继承指导老师19人。
医院始终坚持“以顾客为关注焦点，以员工为中心，以中医药为本，永续创新”的宗旨和“追求诚信卓越，共享仁爱健康”的院训，明确医院的目标定位，突出中医药特色，加快实施服务立院、人才兴院、科研强院和名医、名科、名院的“三名”战略，初步实现了“患者满意、员工爱戴、专家认同、社会推崇”的发展目标。医院现有4个“国家临床重点专科(中医专业)”(心血管病科、骨伤科、皮肤病科、肺病科)，10个国家中医药管理局“十二五”重点专科[心血管科、骨伤科、内分泌科、急诊科、皮肤科、肺病科、针灸科，重症医学科(培育项目)、临床药学(培育项目)、护理学(培育项目)]，8个国家中医药管理局重点学科[中医骨伤科学、中医皮肤病学、中医老年病学、临床中药学、中医肺病学、中医心病学、中医络病学(培育项目)、中医文化学(培育项目)]，4个国家中医药管理局区域中医(专科)诊疗中心项目[肺病专科、皮肤病专科、心血管专科、急诊(重症医学科)专科(培育项目)]
医院中医药特色享誉全国各地，常年开展的中医特色诊疗技术项目达120余项，针灸、推拿、小针刀、中医食疗、中药熏洗、浸浴、溻渍、贴敷等中医特色技术项目深受广大患者的欢迎。同时，医院拥有PET-CT、ECT、电子直线加速器、3.0T磁共振、双源CT、DSA、数字胃肠机、4K高清腹腔镜、检验流水线等先进的医疗设备，开展了心脑血管介入治疗、心脏搭桥手术、人工关节置换手术、脊柱椎间孔镜手术、胸腔镜手术、关节镜手术、经内镜支气管热成型手术、支气管镜电磁导航技术、气管内硅酮支架植入术，房颤冷冻球囊治疗，血管内热交换降温等多学科手术，部分技术处于疆内领先水平。
近年来，医院坚持以“打基础，建机制，重创新”的科研发展战略，加强科研工作，科研能力取得了长足进步。医院各级各类科学研究立项课题层次和数量提升迅速。2018-2022年医院共获得各类科研项目581项，其中国家级项目29项，省部级项目253项，获得资助金额达1亿5千余万元。近五年，医院共获得各类省级和厅局级科技奖励19项。发表各类论文2624篇，其中SCI论文105篇，获得国家食品药品监督管理局药物临床试验批件3项，发明专利10项，科技成果登记87项，软件著作权证书7项。
作为新疆医科大学第四临床医学院，我院设有13个临床教研室：中医内科教研室、中医外科教研室、中医妇科教研室、中医儿科教研室、中西医结合内科教研室、中西医结合外科教研室、中西医结合妇科教研室、中医骨伤教研室、中医推拿教研室、诊断学基础教研室、护理学教研室、中医康复教研室、针灸临床教研室。博士点3个、硕士点8个(中西医结合一级学科博硕士学位授权点、中医博士专业学位授权点、中医学一级学科硕士学位授权点、中药学一级学科硕士学位授权点、中医、中药学硕士专业学位授权点、临床医学一级学科博硕士学位授权点)、国家级一流本科专业建设点2(中医学、中药学)个。2022年获批“国家中医临床教学培训示范中心”；中华医学会医学教育分会和中国高等教育学会医学教育专业委员会医学教育研究课题4项。
医院在中医药国际交流与合作领域积累了丰富的经验，2022年3月承办的线上“上海合作组织成员国临床医学论坛”，与俄罗斯、哈萨克斯坦、塔吉克斯坦、乌兹别克斯坦4个国家的5所国立医疗机构签订了医疗合作协议，建立了长期线上线下交流、远程服务等互联互通机制。
在国际教育及传播中医药文化方面不断推进国际教育高质量发展，承担新疆医科大学国际教育学院外籍学生和中西医结合专业学位硕士留学生的教学培训工作。近十年来我院共接收来自哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦、乌兹别克斯坦、俄罗斯等国家门诊患者数千人次、住院患者2045人次，通过针灸、康复等中医中药手段治疗，取得了良好的效果，在新疆周边国家中树立了中医中药良好口碑。
医院先后获得“全国卫生系统先进集体”“全国卫生系统行风建设先进单位”“中医药科技管理工作先进集体”“全国中医护理先进集体”“全国医院(卫生)文化建设先进单位”(4次)“全国卫生系统思想政治工作先进单位”、“全国百家改革创新医院”、“全国人文爱心医院”、“中国抗疫医疗专家组组派工作表现突出单位”等称号，连续六届荣获“全国文明单位”称号。2003年，医院在全疆三级甲等医院中率先通过了ISO9001：2000质量管理体系认证，2011年通过ISO15189实验室医学标准认可。2013年，医院伦理委员会被世界中医药学会联合会伦理审查委员会确定为“中医药临床研究伦理审查平台”单位。