新疆维吾尔自治区中医医院儿科成立于1978年，是新疆维吾尔自治区中医医院最早的国家中药新药临床药品试验基地之一，中医儿科教研室，中医儿科住院医师培训基地，徐荣谦全国名老中医传承工作室新疆医科大学附属中医医院传承工作室分站，新疆儿科疑难危重专科联盟常务理事单位。承担了本科、研究生、继续医学教育的课堂教学和实习生、研究生、住培学员的临床带教任务。儿科门诊设专家诊室1间，普通诊室2间，输液室及抢救室各一间，一体化儿科药房及儿科临检室各1个，小儿推拿室2间。儿科年门诊量达7万余人次，儿科病区27张床位，年收住院病人总数1800余人。儿科始终把握以医疗为基础，教学为中心，科研为主导的发展方向，多年来致力秉承和发掘先辈的学术思想，集中医百家之长，立足西北，结合新疆患儿的发病特点，形成了目前具有新疆地域特色的中医儿科诊疗理论，学科努力发展中医儿科优势病种的诊疗，中医西医优势互补，大力开展中医特色诊疗技术，发挥以治未病为主导，针对小儿反复呼吸道感染、急性发热、惊厥、肺炎喘嗽、小儿哮喘、厌食、腹痛、腹泻、过敏性紫癜、肾病、抽动症、自闭症、厌食、疳证等小儿常见病、多发病、急慢性疾病及儿科疑难杂病、急危重症的诊治。并开展了调理小儿亚健康体质的四季膏方、治未病、康复、推拿、穴位按摩、伏九贴、穴位贴敷、气息导引、食养等多元化特色治疗，取得了一定的疗效和较广泛的社会认可。科室现有医护人员26人，其中医生9人，护士17人，其中硕导2人，研究生学历4人占45%。