新疆维吾尔自治区中医医院妇科，开设了妇一科、妇二科。妇一科：新疆维吾尔自治区中医医院妇科建立于1956年，秉承中西医结合治疗妇科疾病的理念，坚持发挥中西医治疗优势，中医特色浓厚，现代医学发展更是与时俱进。经过60余年的发展，开展先进的微创技术，中医康复理疗技术。长期积累、潜心钻研、形成特色、实现了中医特色、实现了中医技术突破与创新。研发特效配方药物，创立了“消瘤丸”、“子宫锭”、“苦艾洗液”等有效的院内制剂。培养出约有60余名硕士研究生，是一个集临床、科研、教学为一体的大型综合性科室，拥有一支具有高深理论水平、临床经验丰富的专家队伍。妇一科共有医务人员8人：拥有高级职称2人；副高级职称3人；中级职称3人；硕士生导师2人。其中硕士学位5人。妇一科在学科带头人郭英主任的带领下，广泛开展妇科各类手术，如经腹及腹腔镜下子宫肌瘤剔除术、卵巢囊肿剔除术、异位妊娠手术、全子宫切除术，盆底重建手术、经闭孔无张力尿道中段悬吊术（TVT-O手术），子宫脱垂、阴道前后壁膨出、膀胱直肠脱垂等手术及各类经阴式手术（如阴式全子宫切除术、阴道前后壁修补术），宫腔镜手术、全程超导可视人流系统、电子阴道镜，子宫输卵管超声造影、盆底康复等。积极传承发扬中医药特色，开展针灸、推拿、足浴、中药灌肠理疗、穴位贴敷、中药封包、阴道中药熏蒸及术后康复治疗等项目。发挥中医药治疗优势，运用中医药治疗功能性月经失调的“中医周期疗法”、“中西排卵”及慢性输卵管性不孕、免疫性不孕、高促性腺激素闭经等妇科慢性疑难病症中西医综合疗法。妇二科：新疆维吾尔自治区中医医院妇二科是一个集中医、中西医结合、临床、科研、教学于一体的专科，是新疆医科大学中医、中西医结合妇科专业硕士培养科室，也是中医妇科学药物临床试验质量管理规范基地。目前妇科在编床位数为56张，门诊设有专家门诊、专病科门诊、普通门诊，疑难病会诊门诊，专科年门诊量达到88316人次，年收治病人数为2625人次，本科现有专业技术人员9人，其中高级职称6人（包括副高级职称5人），具有博士学位1人，硕士学位7人，硕士生导师4人。拥有全自动液相膨宫泵、全自动气腹机(含腹腔镜及手术器械)、全数字B超监视妇产科手术仪、超声刀系统、妇科不孕症诊疗仪、子宫组织粉碎器、宫腔镜阴道镜一体机、宫颈椎切刀（含吸烟器）、微波治疗仪、内窥式流产吸引系统。在中医治疗妇科病上，中药周期调理卵巢功能具有疆内的领先水平，与国内水平相差无几。中西医结合治疗妇科肿瘤，子宫内膜异位囊肿，子宫内膜异位症，盆腔静脉瘀血症及中医药防治早期宫颈癌的研究均取得同行业一致好评。同时现在妇科已开展了宫腔镜检查，配合中医中药治疗，使妇科内分泌疾病疗效更确切。中医或中西医结合治疗急性，慢性盆腔炎很有优势。通过中药内服，中药保留灌肠各种理疗及离子导入，后穹隆穿刺靶向给药等治疗盆腔炎，并通过现代科学技术，细菌培养及药敏实验选择有效抗生素治疗，效果理想。平均每年门诊有10-15%的患者就诊治疗盆腔炎。妇科治疗盆腔炎很具有特色，疗效肯定，具有一定的领先水平。另外，妇科还参加了全国妇科感染性疾病的临床研究，为盆腔炎的规范化治疗拟定指南。目前可普遍开展妇科各类手术，如经腹及腹腔镜下异位妊娠手术、经腹及腹腔镜下卵巢良性肿瘤剔除术、经腹及腹腔镜下子宫肌瘤剔除术、经腹及腹腔镜下子宫次全切及全切术、经阴道子宫全切术、宫颈癌根治术，子宫内膜癌根治术，卵巢癌根治术、宫腹腔镜联合检查术等。手术病人及质量逐年增加。