甘肃省肿瘤医院泌尿外科是省泌尿系统、男性生殖系统肿瘤的临床、科研、教学中心之一。甘肃省抗癌协会泌尿及男性生殖系统肿瘤专业委员会副主委单位，设置床位22张；现有主任医师1名，副主任医师1名，主治医师2名；护理人员22名，其中主管护师3名，护师11名，护士8名。
在科室主任李军主任医师的带领下，本科专业技术人员开展了肾上腺肿瘤切除术、肾癌根治术、膀胱癌根治术、阴茎癌腹股沟淋巴结清扫术、睾丸及附睾肿瘤切除术、腹膜后淋巴结清扫术等手术。近年来开展了进展期肾癌的分子靶向治疗、介入治疗、生物治疗，并对前列腺癌、膀胱癌及睾丸恶性肿瘤采用手术治疗结合放化疗的综合疗法，取得了良好的疗效。引进了腹腔镜、德国STORZ前列腺电切镜、输尿管镜等先进设备，使用微创外科技术，治疗膀胱肿瘤，前列腺增生，前列腺癌，肾脏肿瘤，对病人损害小，术后恢复快、痛苦少。在省内较早开展泌尿男性生殖系统肿瘤MDT工作，使肿瘤患者得到个体化、规范化诊治，延长患者生存，提高患者生活质量。
近年在国家级专业学术核心期刊发表论文十多篇，其中SCI2篇，完成科研课题3项，获甘肃省皇甫谧中医科技三等奖1项。
紧跟医院发展步伐，利用院肿瘤医院品牌，多学科联合协同发展，将泌尿外科打造成省内一流泌尿系统及男性生殖系统肿瘤专科以手术治疗为主，并开展相关综合治疗，将科室做大做强，期待成立前列腺癌诊疗中心，肾癌诊疗中心，膀胱癌诊疗中心等专病治疗体系，最终努力建成甘肃省重点科室和临床诊疗中心。