福建省南平市第二医院男科门诊设在门诊四楼西侧，成立于2013年10月，科室配有各种先进的诊疗设备，如伟力彩色精子运动分析系统、性功能监测仪、性功能康复治疗仪等。在检查方面能开展计算机精子运动分析、阴茎夜间勃起试验、阴茎龟头敏感度测定、阴茎海绵体超声血流测定、睾丸穿刺、阴茎海绵体注射，可对男性不育、性功能障碍（阳痿、早泄）、慢性前列腺炎等疾病进行诊断。治疗方面开展勃起功能康复治疗、前列腺特色疗法、早泄特色疗法、中药离子导入、穴位注射、穴位埋线、包皮环切等多项国内先进技术。其诊治范围主要有：1.前列腺疾病：如急、慢性前列腺炎、良性前列腺增生症、前列腺癌等。2.男性不育：如弱精子症、少精子症、精液不液化、死精子症、无精子症等。3.男性性功能障碍：有勃起功能障碍、早泄、性欲低下、射精痛、不射精等。4.外生殖器官感染性疾病如：如包皮炎、非淋菌性尿道炎、生殖器疱疹等。5.男科杂病：如包皮过长、睾丸炎、附睾炎、睾丸鞘膜积液、精索静脉曲张、血精、遗精、更年期综合征等。6.孕前优生检查及咨询。7.婚前检查及咨询。