广州医科大学附属第一医院病理科，于1958年3月成立，最初行政上隶属于检验科，1984年独立成科，2015年成为住院医师规范化培训基地，2019年加入了粤港澳病理联盟。

病理科以呼吸、泌尿、淋巴造血及消化系统等疾病病理诊断为特色，尤其在肺部小结节术中快速冰冻诊断和早期肺癌的病理诊断方面，达到广东省领先水平。病理科还参与胸外科、胃肠外科、泌尿外科、妇科、血液内科等多个科室的MDT诊疗工作，开展肿瘤相关基因及分子靶点检测技术，不仅为疑难病例诊断增添新的技术手段，更为肿瘤患者的治疗选择及预后判断提供客观依据。

病理科承担进修生、实习生、规培医师的临床带教工作，自2013年起招收硕士研究生，现已毕业4名，在读3名，2014年至今招收及培养临床病理专业规培医师12名。

近年来病理科主要开展肺癌、乳腺癌、淋巴瘤等相关疾病的病理基础研究，承担国家级、省部级等各级科研项目多项，在国内、外期刊发表论文100余篇，其中高水平SCI论文多篇。