瑞金医院消化内科迄今已有70年的历史，1980年被国家教委和国务院学位委员会批准为硕士点，1984年批准为博士点，2000年被批准为博士后流动站。1990年被批准为国家教育部消化内科重点学科组成单位之一。1997年成为国家211工程上海交通大学医学院消化重点学科组成单位，同年被国家卫生部批准为国家药品临床研究基地。2010年入选卫计委国家临床重点专科。多名骨干在中央保健委员会担任干保工作。

瑞金医院消化内科拥有消化门诊、消化病房、消化内镜中心、胃肠动力研究室和消化实验室等部门。总面积5003m2，开放床位数72张。每年门诊诊治病人16.6万人次左右，出入院病人5154人次，内镜检查及治疗7万余人次。

瑞金医院消化内科拥有有一批德高望重、学识渊博、国内外知名的老专家，如：徐家裕、唐振铎、吴裕忻、王冠庭、江石湖、吴云林、袁耀宗等为消化的发展做出了巨大的贡献。获得国家级课题51项,总研究经费达2603万。曾多次获得国家科技进步二等奖、上海市科学技术进步奖二等奖、上海市医学三等奖。共发表SCI248余篇，其中影响因子最高达66.85，总影响因子3556。目前由邹多武、钟捷、王立夫、孙蕴伟组成的核心领导团队引领瑞金消化科向更高的目标发展。瑞金医院消化内科团队现有医师42人，研究员1人。71%医师均具有博士或硕士学位。其中正高级职称7人，副高级职称14人，中级职称17人。消化科医生45%的医生具有美国、法国、澳大利亚、日本等海外学习经历。目前与美国、法国、澳大利亚等国家及香港地区保持良好的合作关系。

瑞金医院消化内科学科特色主要在以下六个方面：（1）炎症性肠病（2）胃肠早癌（3）消化内镜（4）胰腺疾病（5）胃肠功能动力障碍性疾病（6）消化系疑难疾病。在上海市申康病种统计排行中，瑞金医院消化内科的炎症性肠病、胰腺肿瘤、复杂ERCP名列全市第2位，消化道出血名列全市第6位。

瑞金医院消化内科依据综合实力勇于接纳与诊断各种疑难杂症，对疑难杂症的诊治经验丰富，每年接诊大量来自全国各地的疑难疾患者。如：T细胞淋巴瘤、嗜酸性胃肠炎、蓝色紫大疱综合征、胆胰管汇合异常、胰腺分裂症、自身免疫胰腺炎、蛋白丢失性肠病、白塞氏脑病、Cronkhite-Canda综合征、瘤样脂肪增生综合征、静脉硬化性肠炎、一穴肛、消化道淀粉样变性等疑难杂症。