北京中医药大学东直门医院脾胃病科有着悠久、辉煌的历史。董建华院士、殷凤礼教授、田德禄教授等知名专家于1980年率先把消化内科设为独立科室，开创了中医消化内科建科的先河。
本科室作为中医内科重点科室之一，是脾胃病国家中医重点专科（国家卫计委）、国家中医药管理局华北地区中医肝病区域诊疗中心、重点专科、重点学科建设单位，是世界中联肝病专业委员会、北京中医药大学肝病研究所挂靠单位。
经过40多年的建设发展，目前科室设病床33张以及门诊、胃镜室、13C-尿素酶呼气试验检测室、中医综合治疗室。
在胃肠病方面，可开展食管Ph监测、食管测压等专科检查，尤其近年来消化内镜技术快速发展，目前除了常规开展普通胃镜检查、无痛胃镜检查，消化内镜诊疗技术可实现内镜下早癌筛查(染色内镜、高清及放大内镜、超声内镜)与治疗(内镜下黏膜切除术、内镜下黏膜剥离术)、上消化道出血内镜止血术、上消化道狭窄球囊扩张及支架置入术。
在肝胆疾病方面，可开展经内镜胰胆管造影术、肝脏弹性测定。
科室开设了功能性胃肠病、消化系统疑难疾病、代谢异常综合征等专科门诊，以及肝胆胰中医特色门诊，开展了中药脐敷、中药泡洗、耳穴压豆、肝病低频脉冲治疗、红光照射、中药离子导入、皮内针、药枕、中药膏膜等一系列中医特色诊疗项目。
专科形成了一支有影响力的专家团队，擅长诊治慢性肝病（脂肪肝、酒精性肝病、病毒性肝炎、肝硬化及肝癌前病变、肝癌等）、慢性胃病（慢性萎缩性胃炎、难治性溃疡及胆汁反流性胃炎）和慢性肠病（慢性结肠疾病、功能性肠病）。
科室承担了慢性胃病及慢性肝病多项国家级及省部级课题，历年发表多篇有影响力的SCI及中文核心期刊论文，培养了一批博士及硕士研究生，发布了中医药诊治慢性乙型肝炎行业标准，制定的肝硬化腹水中医诊疗方案及临床路径由国家中医药管理局推广向全国。
针对上述消化系统疑难疾病，形成了具有中医药特色与优势的诊治方案，开发出系列院内制剂，受到广大患者的好评。
科室已形成从博士、硕士生导师等高级职称医师到住院医师年龄结构合理的医师队伍，以及经验丰富的护理团队，被授予国家临床研究基地研究型科室。科室坚持临床、教学、科研协同发展，为来自全国各地的患者提供优质医疗服务。