北京中医药大学东直门医院感染科正式成立于2003年，前身是肝炎门诊和肠道门诊，应卫生局的要求，本着四固定六分开的原则，于1982年成立单独的肠道门诊，1983年有了肝炎门诊，有了自己的专区，1984年盖了肝炎肠道的独立工作楼，但没有肠道专职大夫、护士，由内科派大夫、护士每年进行轮转，肝炎的大夫、护士相对固定，人员由少到多，2003年正式成立感染科，人员相对固定。现有教授1人，主治医2人，住院医1人，硕导1人。

科室没有病房，因此门诊工作很多，不但承担着传染病的质量工作，还承担着卫生防疫、流调、健康宣教等工作，门诊量及收入也在逐年上升，2008年门诊量2000多人上升到2010年的6000多人。

科室荣誉：多次获得医院的医疗安全及中医四项指标完成奖；2011年肠道工作获得东城区三等奖。

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