中山大学附属第三医院中心实验室，是医院统筹管理各个实验室、研究平台、样本库和专科实验室的部门。其工作目标是推进医院科研实验平台的建设，推动医院各个学科进行高水平的科学研究，培养高质量的研究人员，产出高水平的科研成果。为提高医院的基础科学研究水平服务，为医院的学科建设和发展服务。目前，实验医学部整合并管理6个公共科研平台（中心实验室、肝病实验室、疫苗研究所、医学研究中心、棠下实验室、岭南医院公共平台实验室）、12个专科实验室以及医院的临床样本资源库。科研实验场地总面积约10000平方米，设备总值近1亿元。实验医学部采用先进的实验室智能管理系统，突破性地跨越四个区域（天河院区、岭南院区、黄村医学研究中心、棠下实验室），连接六个公共科研平台，通过专业的管理和配套硬件，实现了跨区域人员、设备、实验室安全、信息发布和共享等多方面的精细化、统一化和系统化管理，进一步实现资源整合，实现开放、共享。 实验医学部努力为医院的基础科学研究与转化研究、学科建设和人才培养提供最全面、快捷、可靠的场地设施和技术设备支持，推动医院的科技创新，促进医院科技资源的高效配置和综合利用，提升我院的科技核心竞争力和人才吸引力，全面助推健康中国建设。