哈尔滨市中医医院肛肠外科2001年被黑龙江省中医管理局批准为“哈尔滨中西医结合大肠肛门病治疗中心”，2003年8月被黑龙江省中医管理局批准为“黑龙江省中医肛肠病重点学科”、“黑龙江省肛肠病继续教育基地”，该科室“肛肠物理检测实验室”被认定为国家二级实验室，2004年底肛肠科通过“黑龙江省中医重点专科”验收，2006年12月被确定为哈尔滨市政府重点学科，2007年2月被确定为黑龙江省政府重点学科，2007年12月被国家中医药管理局确定为中医重点专科建设单位，2011年9月通过国家中医药管理局十一五重点专科验收，成为国家级重点专科，2012年通过严格的评审，被确定为国家卫生部临床重点专科。通过不断地发展与建设，现肛肠中心拥有6个专业科室，床位323张，年门诊量达6万余人次，手术达6千余例，区域外住院患者比例达到32.2％。学科的影响越来越大，其医疗任务、诊疗水平、科室规模、综合实力在全省居于领先地位，在国内有较高的知名度，在群众中有较高的信誉与口碑，从而确立了省内本专业的“龙头”地位。肛肠科现有专业技术人员40余名，其中正高职11名，副高职13名，主治医师12名，住院医师15名，具有博士学位2人，硕士学位15名，专业技术人员知识结构合理，老、中、青三结合，具有良好的学术发展潜力和人才建设梯队。现拥有国家级肛肠学会副主任委员1名；国家级肛肠学会常务委员（常务理事）6名；黑龙江省级肛肠学会主任委员（会长）1名；龙江名医1名，省名中医1名，省级肛肠学会副主任委员（副会长）3名；省级肛肠学会常务委员（常务理事）8名；哈尔滨市级肛肠学会主任委员1名；副主任委员2名；市级肛肠学会委员5名；通过不断地学术交流与学术研究，了解和掌握本专业学术动态和各种新技术。肛肠科（肛肠中心）拥有先进专科检查治疗设备，如日本东芝电子肠镜、美国产氩气手术刀、德国产超声刀、智能型肛门直肠压力测定仪、丹麦产肌电图诊断仪、带直肠探头B超、X线排粪造影，6个标准化手术间、ICU病房等。“肛肠物理检测实验室”被认定为国家二级实验室。同时医院拥有多种大型先进配套设备，如：核磁共振、美国GE全身双螺旋CT机、岛津500mA遥控X光机、美国百胜AU5彩色多普勒B超诊断仪、美国GE公司B超诊断仪、德国DWL经颅多普勒B超诊断仪、美国QBC-R血常规测定仪、日立全自动生化分析仪、美国2A型麻醉机、大型微波治疗仪、美国百特血液透析仪、CCU监护设备等大型医疗设备。肛肠科（肛肠中心）能开展肛肠科各种常见病、多发病及疑难杂症的诊治及微创治疗技术，如痔上粘膜环切技术-PPH技术，痔上粘膜套扎技术-RPH技术，肛瘘（肛周脓肿）直肠腔内超声定位诊断技术；肛瘘（肛周脓肿）MRI定位诊断技术；肛瘘（肛周脓肿）分段开窗中药线挂线引流技术；高位复杂型肛瘘括约肌保留治疗技术；生物蛋白胶封堵治疗肛瘘技术；直肠阴道瘘会阴入路修补技术；直肠脱垂微创治疗技术；便秘排粪造影及结肠运输实验检查技术；中西医结合治疗便秘技术；中药保留灌肠治疗炎性肠病技术；大肠息肉经肠镜微创治疗技术；肛门畸形矫形技术；肛门失禁、会阴撕裂括约肌修补肛门成形技术；肛门会阴部坏死性筋膜炎诊治技术；大肠癌微创治疗技术；直肠癌低位保肛技术；直肠肛管压力测定；生物反馈治疗便秘等等。肛肠科（肛肠治疗中心）以精准的术前诊断，微创化、无痛化的治疗手段，突出中医特色，服务于广大肛肠疾病患者。