不同组织器官进行磁共振检查所需时间不同，如进行头颅磁共振检查，通常为15-20分钟。如果进行乳腺磁共振检查通常为一小时，进行心脏磁共振检查是1-1.5小时。 核磁共振成像非常复杂，主要为磁场成像，有信号采集。而采集信号可用到很多方法，有各种序列，常提到的有自旋回波序列、梯度回波序列，有时需用到压脂序列，还有自由水抑制、短时反转恢复序列，很多序列。部分患者还需做增强，而进行增强检查注射药物也需一定时间，故笼统来说，核磁共振所需时间相对较长。

核磁共振属于磁场成像，有良好的空间分辨率，同时对软组织病变、脊髓观察较详尽，对检查韧带非常有益。某些部位损伤，如膝关节损伤日常生活中常遇到。而膝关节损伤往往在正常的X光片无法看到软组织、韧带，包括肌肉改变，但在核磁共振可清楚显示，包括前交叉韧带、后交叉韧带、内外侧副韧带均可进行较好观察。 同时核磁共振属于还可显示半月板改变，如半月板有无撕裂及半月板损伤分级，均可进行很好的观察。所以，磁共振检查韧带、肌肉、肌腱，包括观察软组织肿块对日常工作、开展诊断治疗有很大帮助。

很多患者担心核磁共振对人体有影响，其实核磁共振非常安全，可放心进行检查。因核磁共振是磁场成像，与传统X线成像和CT成像有区别，X线成像、CT成像均为X线成像方式，所接触检查可受到X线辐射。而磁场成像反映信号的特点，故磁共振检查对人体无损伤。 但如果患者四肢有内固定器，或体内有金属假牙、体内有金属支架，均可影响核磁共振检查。因金属会干扰磁场成像，所以，有植入物的患者需避免进行核磁共振检查。同时部分患者患有幽闭综合征，也不建议进行核磁共振检查。