肺真菌病诊断有三个方面： 1、危险因素：患者是否有免疫缺陷，如肺部肿瘤或者其它全身性的肿瘤、血液病、糖尿病，以及是否长期服用免疫抑制剂； 2、临床表现：患者是否有咳嗽、咳痰、发热、胸痛、 胸闷、呼吸困难等症状；如果患者有上述症状，给予普通的抗感染治疗没有效果，也要考虑是否有真菌病； 3、相关检查：包括G试验、GM试验、荚膜多糖抗原试验、痰培养、血培养，其中痰培养需要两次以上的培养，必须是同种真菌才能作为诊断，同时必须镜检见到菌丝或孢子，诊断肺真菌病的金标准是病理检查。

肺真菌病治疗非常复杂，疗程比较长。不同肺真菌病治疗时间也不同。最容易治疗的念珠菌肺炎，治疗时间需要根据患者的临床症状以及肺部病灶吸收的时间来决定。 对于隐球菌性的肺炎，治疗时间至少需要半年以上。如果肺隐球菌同时合并隐球菌脑膜炎，则治疗时间需要延长到一年以上。对于曲霉菌感染的肺炎，治疗时间至少为16周；有些患者还需要通过手术治疗，手术以后还需口服14周的药物。 总之，肺真菌病的治疗复杂，时间久，建议患者前往专科医院得到正规的治疗。

肺结核痰液检查阴性有可能会传染。肺结核不是只有痰液检查阳性的患者才会有传染性，大部分痰液检查阴性的患者也具有传染性。 接触痰检查阴性患者，要做好防御措施，不要面对面大声交谈或面对面咳嗽。家中有肺结核痰检阴性患者，要做好防御工作，减少在室内大声说话和咳嗽的次数，同时保持家中的通风。家中其他成员要加强营养、注意休息、避免熬夜等损伤免疫功能活动。