穴位埋线疗法的适应症非常广，凡是针灸的适应症都是穴位埋线的适应症，好多内科性的疾病，消化系统的慢性萎缩性胃炎、胃下垂、功能性的消化不良、便秘、腹泻和溃疡性结肠炎，以及内分泌疾病、糖尿病、甲状腺功能紊乱。肺系疾病，支气管哮喘、过敏性鼻炎、咽炎、慢性支气管炎以及神经精神系统疾病，顽固性的失眠、癫痫、抑郁症、焦虑症等，脑血管意外造成后遗症等，妇科疾病，多囊卵巢、月经不调、乳腺系统的疾病。单纯性的肥胖、皮肤病、黄褐斑、银屑病等，都是穴位埋线的适应症。