中山大学附属第七医院消化医学中心（以下简称中心）2018年5月11日与医院同时开业，作为医院的龙头科室，秉承学科融合建设理念，下设胃肠外科、消化内科、内镜中心，集医疗、教学、科研和管理为一体，为患者提供一站式全生命周期服务。
中心致力于消化道肿瘤、肛肠疾病、腹壁疝、炎症性肠病、肝病、功能性胃肠病等疾病的诊治，年均内镜诊治近3.5万人次，住院患者满意度达99%以上，进展期胃癌术后总的5年累计生存率超60％，消化道早癌诊断率26.7%，牵头制定了《中国消化外科抑酸药物规范化使用的临床实践指南（2022版）》和《中国人群胃癌风险管理公众指南（2023版）》。
中心传承于中山大学附属第一医院王吉甫教授1964年所创立的胃肠外科，并在此基础上不断发展与超越。
【人员队伍】
中心学科带头人为著名胃肠外科专家何裕隆教授和张常华教授，中心主任为杨东杰主任医师，中心医疗副主任为吴文辉主任医师、教学副主任为李明哲副主任医师、科研副主任为齐健主任医师，现有医师50人，获博士学位者26人，深圳市国家级领军人才1人，深圳市地方级领军人才1人，博士生导师/硕士生导师17人，主任医师6人，副主任医师6人，心理治疗师1人，康复治疗师1人，护理团队76人。
【诊疗范围】
消化一科临床诊治范围：
1、胃肠道肿瘤
胃癌、结直肠癌、食管癌、胰腺癌、胃肠间质瘤、胃肠道淋巴瘤、神经内分泌肿瘤、腹膜后肿瘤、小肠肿瘤等。
2、疝和腹壁外科疾病
腹股沟疝、股疝、闭孔疝、脐疝、腹壁白线疝、切口疝、腹直肌分离、胃食管反流病、食管裂孔疝、腰疝、腹壁肿瘤等。采用多模式、个体化策略制定手术方案并坚持随访。微创手术率超过90%，重视加速康复和疼痛管理，大部分患者在手术后6小时，即可恢复生活自理。
3、肛肠良性疾病
痔疮，肛瘘、肛周脓肿、直肠脱垂、肛裂、便秘等肛肠良性疾病的手术治疗。
4、营养代谢疾病
各种营养代谢紊乱疾病的外科治疗、围手术期的营养康复、肥胖症和糖尿病的外科手术治疗（减重手术）等。
5、腹部外伤及各种急腹症
各种腹部外伤；消化道穿孔、肠梗阻、急性阑尾炎等各种急腹症。
6、消化道出血
食管胃底静脉曲张、消化道溃疡、消化道肿瘤、消化道血管畸形等引起的消化道急性出血。
消化二科临床诊治范围：
1、肝病和消化道出血的综合规范化诊治，包括病毒性肝炎、肝硬化及肝癌、脂肪性肝病、药物性肝病、自身免疫性肝病、肝脏血管瘤及肝囊肿等，肝硬化失代偿期消化道出血的内镜治疗及二级预防。内痔及内痔出血的内镜下治疗。
2、消化道早癌、粘膜下肿瘤（包括胃肠间质瘤、平滑肌瘤和神经内分泌肿瘤等)以及慢性萎缩性胃炎的内镜下早期诊断和内镜下微创治疗。同时常规开展各项消化系统疾病的辅助检查，如13碳尿素呼气试验、无痛电子胃镜检查、无痛电子结肠镜检查、磁控胶囊内镜检查等。
3、胆胰疾病内镜及介入治疗：胆胰腺良性疾病（胆石症、胰管结石及狭窄、急慢性胰腺炎、胆囊炎、自身免疫性胰腺炎及胆管炎）以及胆管癌、胰腺癌、胰腺导管内乳头状粘液瘤、胰腺囊腺瘤等胆胰恶性疾病诊治。
4、炎症性肠病（克罗恩病、溃疡性结肠炎）的综合诊治包括药物及手术治疗，完全肠内营养支持治疗、肠道菌群移植等。各种消化道狭窄的内镜下治疗，如扩张、支架置入、瘢痕放射状切开、阑尾炎的内镜下治疗等。营养疾病的治疗包括肠外肠内营养支持治疗，各种营养失调性疾病的治疗，疾病或者手术前后的营养康复等。
5、胃肠动力障碍性疾病如贲门失弛缓症、胃食管反流病、肠易激综合征、功能性消化不良、功能性便秘等的诊断与治疗，如便秘与腹泻的生物反馈及电刺激治疗、高分辨率食管测压、24小时动态胃酸监测、高分辨率直肠肛门测压等。
【主要成果和奖项】
中心2021年获批广东省消化系统恶性肿瘤防治研究重点实验室和广东省教育厅消化系统恶性肿瘤防治研究粤港澳联合实验室，2023年获批深圳市消化系统疾病（消化外科）临床医学研究中心。