福建医科大学附属协和医院消化科（消化内科）在我国著名消化系疾病专家陈锡谋教授、林谷珍教授、王小众教授的先后领导下不断得到发展，现为福建省临床重点专科、福建医科大学重点学科，是福建省消化系疾病临床诊疗中心之一。消化内科现有90张病床的独立消化病区、消化内镜室与胃肠功能检查室。

学科现有主任医师6名，副主任医师4名，主治医师6名，住院医师11名，其中博士学位13人，硕士学位13人，拥有很强的人才梯队和师资力量，综合实力在福建省消化系病领域保持领先的地位。学科带头人为王小众教授，科主任为陈丰霖主任医师，科副主任为张莉娟主任医师、李丹主任医师。

作为福建省的消化系病临床诊疗中心，消化专科年专科门诊量超过7万人次，每年收治超过2000名的消化系疾病住院患者，其中福建省内及周边省份的外埠患者占相当比重。消化系疾病的病种齐全，成功救治了大量消化系急、危、重症患者，在上消化道大出血、急性出血坏死性胰腺炎、肝硬化肝性脑病、严重败血症、休克等危重病症的抢救治疗上达到先进水平。

消化内镜室与胃肠功能检查室拥有最新型各类电子胃、肠镜，电子十二指肠镜，扇扫与纵轴超声内镜，胶囊内镜，彩色超声及13C红外能谱分析仪等大型诊疗设备与仪器，每年开展的胃、肠镜检查与治疗达3万人次以上。开展的消化道息肉切除，消化道狭窄的扩张及内支架置入，贲门失弛缓的内镜下介入治疗，胆总管结石碎石等各类内镜下微创治疗，使我院的内镜下的介入治疗技术达到省内先进水平。为提高我省超声内镜诊断水平发展超声内镜新技术、提高内镜治疗水平，我院已成功举办了4期福建协和消化内镜论坛，为国家级超声内镜及内镜治疗培训班。

消化内科背靠福建省消化系疾病研究所，主持承担了国家自然科学基金及省自然科学基金等各类科研课题，现有科研经费达1000万元，已在SCI引源及Medline收录杂志发表文章60余篇，已获省科技进步奖共9项。现已在肝纤维化的发病机制与治疗、乙肝病毒分子病毒学与致癌机制、胃癌的实验与临床研究上形成学科的重点研究方向。学科现有内科学消化系病专业博士点与硕士点，为目前福建省消化系病专业博、硕士研究生的主要培养基地。