湖州市中医院儿科是一个以治疗儿内科疾病、儿童预防保健为重点，兼医疗、教学、预防任务为一体的医疗机构。湖州市中医院儿科现有主任医师3名，副主任医师2名，主治医师3名；硕士研究生2名；市级名中医1名。设有门诊、急诊和病房。

近年来，儿科一直保持较多的门诊量、较高的住院率和，治疗了不少疑难重症，成功救治近年的重大公共卫生事件如手足口病、甲型流感、婴幼儿肾结石等。

儿科实行全天候门诊，周一至周六上午均有专家应诊，设有小儿哮喘、肺炎、厌食、易感、腹泻，紫癜病、小儿遗尿、多动症等专病专治，多年来和针灸科合作开展“冬病夏治”的“三伏贴”用于治疗和预防小儿反复感冒、支气管炎、慢性支气管炎、哮喘、久咳久喘、过敏性鼻炎、咽炎等疾病的反复发作，由于突出中医特色，受到普遍欢迎。

自制“杏黄止咳合剂”、“解毒清火饮”、“复方玄参利咽合剂”和“益儿散”等药物治疗小儿急慢性咳嗽、咽炎、腹泻、厌食等疗效显著。儿科病房颇具现代儿科医院的特点，突出“以人为本”的新理念，为小儿营造了温馨、舒适、便利的就诊环境和就医条件，近年来儿科病房条件大大改善，技术力量雄厚、医疗设备不断更新。

对住院患儿的治疗上非常注重中医特色，同时也强调与现代医学的结合，充分利用中西医各自的优势，在小儿疾病治疗中，体现特色。