支气管镜检查开展至今，已积累了丰富的经验其禁忌证范围亦日趋缩小或仅属于相对禁忌证。但在下列情况下，行支气管镜检查发生并发症的风险显著高于一般人群，应慎重权衡利弊后再决定是否进行检查。
1、活动性大咯血；
2、严重的高血压及心律失常；
3、新近发生的心肌梗死或有不稳定心绞痛发作史；
4、严重心、肺功能障碍；
5、不能纠正的出血倾向，如凝血功能严重障碍、尿毒症及严重的肺动脉高压等；
6、严重的上腔静脉阻塞综合征，因纤维支气管镜检查易导致喉头水肿和严重的出血；
7、疑有主动脉瘤；
8、多发性肺大疱；
9、全身情况极度衰竭。
参考资料：[1]万学红，陈红.临床诊断学.第3版[M].北京.人民卫生出版社.2015.