盐酸氨基葡萄糖胶囊与硫酸氨基葡萄糖胶囊均可用于预防或治疗全身骨关节炎，并缓解或消除骨关节炎所致疼痛、肿胀等，两者的区别在于成分、疗效、副作用等，需要在医生指导下使用。
1、成分区别：盐酸氨基葡萄糖胶囊主要成分为盐酸氨基葡萄糖，呈白色或类白色，经口服容易通过小肠被吸收，再以氨基葡萄糖的形式进入血液。而硫酸氨基葡萄糖胶囊主要成分为硫酸氨基葡萄糖，呈类白色或浅黄色，属于生理活性物质，是经盐酸氨基葡萄糖转化而成，机体耐受性良好。
2、疗效区别：硫酸氨基葡萄糖胶囊中含有硫酸盐，有助于人体对氨糖的吸收，治疗效果较好。而盐酸氨基葡萄糖胶囊中含有的盐酸根，较难被机体吸收、利用，但本品纯度较高。
3、副作用区别：盐酸氨基葡萄糖胶囊中含有较多氯离子，会对胃肠道造成刺激，容易诱发恶心、腹痛等不适，且氯离子过多还会对肝肾功能造成不良影响。而硫酸氨基葡萄糖胶囊也可引发胃肠不适，有便秘、腹泻等症状，还会出现嗜睡。
因此，使用盐酸氨基葡萄糖胶囊与硫酸氨基葡萄糖胶囊期间需注意观察自身状况，避免随意与其他药物联用，但可以遵医嘱 联用抗炎、镇痛类药物，以免单独使用而治疗效果不佳。