对于不同保存方法的咸鸭蛋，可以保存的时间一般也会存在差异，通常在3-12个月不等。
咸鸭蛋为鸭蛋通过盐腌制而成，其保质期相对于普通的鸭蛋而言，一般会相对偏久。对于自行在家制作的咸鸭蛋，由于没有特殊包装保存，因此保存时间一般较短，为3-6个月。而对于市面上售卖的真空包装咸鸭蛋，因为真空状态下，不利于微生物生长繁殖，故而保质期相对会延长，在6-12个月。
但需要注意，不论是自己制作的咸鸭蛋，还是市面上售卖的咸鸭蛋，若一直将其放置于常温、高温环境中保存，由于保存环境不适宜，其所能存放的时间可能会有所减少，甚至部分咸鸭蛋不到3个月就出现变质的情况。
而变质的咸鸭蛋中会存在多种病原微生物，人体吃了这种咸鸭蛋后，一般会引起腹痛、腹泻等急性胃肠道不适症状。对于少部分人群，还可能由于变质咸鸭蛋摄入过多，使得自身出现全身性食物中毒的现象。
因此，吃咸鸭蛋时一定要观察其性状，在明确气味、颜色等没有异常的情况下才建议吃。