西红柿发芽了一般不建议食用。由于放置时间过长或环境潮湿导致内部水分较多，西红柿可能出现发芽的情况。建议丢弃，不宜食用。
西红柿发芽后营养价值会降低，且可能会产生有毒物质即龙葵素。如果是放在潮湿的环境中而发芽，则西红柿内部可能会有细菌、真菌的感染。如果是食用了含龙葵素或菌类感染的发芽西红柿，量少可能会出现腹痛、呕吐等胃肠道不适症状，量多则可能伴随体温升高、呼吸困难等全身症状。
新鲜的西红柿中含有丰富的维生素和微量元素，能给人体提供营养，其番茄红素含量也较高，适量食用有利于人体健康。此外，新鲜的西红柿中还含有膳食纤维素，可促进胃肠蠕动，防止便秘。适量食用新鲜的西红柿，有助于为机体补充营养物质，对自身健康有一定的好处。