肠系膜淋巴结肿大的治疗方法主要有家庭处理、一般治疗、药物治疗，以及手术治疗。
一、家庭处理
若病人属于肠系膜淋巴结肿大的缓解期，并无严重的临床表现，多可通过饮食调整，可给予清淡、易消化、营养丰富的饮食，并且需避免给予辛辣刺激性的食物，以免加重胃肠道不适症状，若病人存在低热，可给予温水擦浴、冰袋等进行物理降温，以促进病人好转。但是若病人症状严重，需要及时就医，以免耽误病情。
二、一般治疗
建立静脉通路，予以补液，进行原发病治疗。
三、药物治疗
1、利巴韦林
本病治疗过程中主要针对因病毒感染所致的肠系膜淋巴结肿大，以减轻病毒对局部淋巴结的浸润，促进病情康复。
2、头孢曲松
主要是针对于本症状中因细菌感染所致的肠系膜淋巴结肿大，帮助患者杀灭病原菌，以促进病人康复。
3、阿奇霉素
主要用于本症状中因肺炎支原体感染所致的肠系膜淋巴结肿大，有利控制肺炎支原体引起的感染症状。
4、龙血竭片
龙血竭片属于中成药，并且其表面有肠溶衣结构，有利于提高药物有效成分在人体内的利用率，促进患者康复，并且该药具有活血化瘀、消炎止痛的功效，有利于抑制肠道内细菌的生长，以促进肠系膜淋巴结肿大的消退。
5、莫沙比利
莫沙比利属于促肠蠕动药，有利于促进肠道排空，从而减轻肠道不适症状，抑制细菌繁殖。
6、整肠生
整肠生属于口服益生菌制剂，不仅可以保护胃黏膜，还可促进肠道菌群平衡，有利于减轻肠道症状。
四、手术治疗
1、阑尾切除术
若肠系膜淋巴结肿大者的病因为急性阑尾炎，同时伴有阑尾周围脓肿或阑尾穿孔，应及时进行阑尾切除术，以防止并且进展。
2、肠段切除术
若肠系膜淋巴结肿大者的肠段已经无法复位或坏死，需要及时进行肠段切除术，并进行肠管吻合，以保护残余肠管。