吃完益生菌肚子咕咕叫，可能是益生菌在肠道内的正常反应，也可能是因为肠易激综合征等原因导致。在明确原因后，可以在医生的指导下进行针对性治疗。
1、正常反应：益生菌可以通过改善肠道内菌群平衡，促进营养吸收，保持肠道黏膜屏障功能，促进肠道健康。吃了益生菌之后肚子咕咕叫，可能就是益生菌发挥了作用，促进胃肠道蠕动，帮助胃肠道对食物的吸收和消化。如果没有腹泻、腹痛等其他不适症状，就不需要停药，继续观察即可。如果症状仍然明显，建议停用益生菌类药物，症状可以自行缓解；
2、肠易激综合征：若患者出现肠易激综合征，服用的益生菌温度过低或者过酸，可能刺激肠道蠕动，容易引起肠鸣音亢进。这种情况下，可以在医生的指导下服用西沙必利片、莫沙必利片、马来酸曲美布汀片等药物进行缓解。
此外慢性肠胃炎也可以导致服用益生菌后出现肚子咕咕叫的症状，患者应及时就诊，并完善相关检查。